實驗目的：將全基因組DNA樣品進行200-500bp區(qū)間的均一性片段化處理。
　　
實驗儀器及材料：
　　
1.實驗儀器：本次實驗選用三款非接觸打斷儀器如下：小美超聲-高通量聲波基因組剪切儀、bioruptor-非接觸式超聲破碎儀、小美超聲-聚能式超聲波DNA打斷儀。
　　
2.實驗材料：核酸濃度為160 ng/μL的全基因組DNA溶液。
　　
實驗步驟：
　　
1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機啟動，設置溫度為4℃。
　　
2.將每個愛思進品牌的1.5 mL EP管加入100 μL 濃度為160 ng/μL的全基因組DNA溶液。

3.將2管裝好樣品的1.5 mL EP 管分別放入三款儀器的適配器當中，其他空余的孔位由加同樣體積水的1.5 mL EP 管補齊。
　　
4.程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長15分鐘和20分鐘，二個梯度對比。
　　
5.程序結束后，取出樣品使用毛細管電泳進行基因組片段化檢測。
　　
實驗結果：
　　
1.小美超聲-高通量聲波基因組剪切儀
　　
①程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長15分鐘

平均片段大?。?10.0 bp

片段范圍 bp	占比 %
25-100	4
100-200	21.3
200-500	64.7
500-904	10

②程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔10s，總時長20分鐘
　　
平均片段大?。?00.1 bp

片段范圍 bp	占比 %
25-100	4.2
100-200	22.7
200-500	64.3
500-904	8.8

2.bioruptor-非接觸式超聲破碎儀

①程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長15分鐘

平均片段大?。?32.9 bp

片段范圍 bp	占比 %
24-100	1.4
100-200	7.8
200-500	58.3
500-891	32.5

②程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長20分鐘

平均片段大?。?05.8 bp

片段范圍 bp	占比 %
24-100	1.5
100-200	9.5
200-500	63.2
500-904	25.8

3.小美超聲-聚能式超聲波DNA打斷儀

①程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長15分鐘

平均片段大小：365.5 bp

片段范圍 bp	占比 %
24-100	2.1
100-200	13.6
200-500	65.4
500-904	18.9

②程序設置：溫度4℃，超聲工作時間20s 間隔時間10s，總時長20分鐘

平均片段大?。?88.1 bp

片段范圍 bp	占比 %
24-100	1.9
100-200	12.3
200-500	62.2
500-904	23.6

4.三款儀器實驗結果匯總

	總時長15分鐘 200-500 bp區(qū)間占比	總時長20分鐘 200-500 bp區(qū)間占比	峰圖趨勢
小美超聲-高通量聲波基因組剪切儀	64.7%	64.3%	平緩
bioruptor-非接觸式超聲破碎儀	58.3%	63.2%	陡坡
小美超聲-聚能式超聲波DNA打斷儀	65.4%	62.2%	陡坡

注：當基因組片段在200-500 bp區(qū)間占比越高，峰圖越平緩狀時，說明基因組片段的均一性更好，反之亦然。

在樣品、程序設定等條件相同的情況下，bioruptor的非接觸式超聲破碎儀和小美超聲的聚能式超聲波DNA打斷儀在200-500 bp區(qū)間占比分別達到58.3%和65.4%，且二者峰圖呈陡坡狀，表明基因組片段化均一性差。

小美超聲的高通量聲波基因組剪切儀在200-500 bp區(qū)間占比達到64.7%，峰圖呈平緩狀，表明基因組片段均一性更好。