ChIP實(shí)驗原理：是在活細(xì)胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)－DNA復(fù)合物，并將其隨機(jī)切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段，然后通過免疫學(xué)方法沉淀此復(fù)合體，特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。

　　1. 細(xì)胞交聯(lián)（Crosslinking）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模和ㄟ^甲醛交聯(lián)將蛋白質(zhì)與DNA結(jié)合固定，形成穩(wěn)定的復(fù)合物。
　　
　　● 實(shí)驗步驟：向細(xì)胞培養(yǎng)基中加入甲醛（通常濃度為1%），孵育10-15分鐘。加入甘氨酸終止交聯(lián)反應(yīng)。收集細(xì)胞，用預(yù)冷的PBS洗滌。
　　
　　2. 細(xì)胞裂解（Cell Lysis）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模毫呀饧?xì)胞，釋放染色質(zhì)。
　　
　　● 實(shí)驗步驟：使用含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液裂解細(xì)胞。離心收集細(xì)胞核。
　　
　　3. 染色質(zhì)打斷（Chromatin Shearing）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模簩⑷旧|(zhì)打斷成200-1000 bp的片段，便于后續(xù)免疫沉淀。
　　
　　● 實(shí)驗步驟：使用超聲儀將染色質(zhì)打斷。應(yīng)用酶解法，使用微球菌核酸酶（MNase）消化染色質(zhì)。
　　
　　● 注意：打斷后需通過瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀檢測片段大小。
　　
　　4. 免疫沉淀（Immunoprecipitation, IP）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模豪锰禺愋钥贵w捕獲目標(biāo)蛋白-DNA復(fù)合物。
　　
　　● 實(shí)驗步驟：將染色質(zhì)片段與目標(biāo)蛋白的特異性抗體孵育（通常過夜）。加入Protein A/G磁珠或瓊脂糖珠，捕獲抗體-蛋白-DNA復(fù)合物。洗滌磁珠，去除非特異性結(jié)合。
　　
　　5. 解交聯(lián)（Reverse Crosslinking）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模横尫臘NA，便于后續(xù)分析。
　　
　　●實(shí)驗步驟：加入含有蛋白酶K的解交聯(lián)緩沖液，65℃孵育數(shù)小時或過夜。加熱使蛋白質(zhì)變性，釋放DNA。
　　
　　6. DNA純化（DNA Purification）
　　
　　●實(shí)驗?zāi)康模杭兓疍NA，去除蛋白質(zhì)和RNA。
　　
　　● 實(shí)驗步驟：使用酚-氯仿抽提或商業(yè)化的DNA純化試劑盒。通過乙醇沉淀或離心柱法回收DNA。
　　
　　7. DNA分析（DNA Analysis）
　　
　　● 實(shí)驗?zāi)康模簷z測目標(biāo)DNA片段。
　　
　　●實(shí)驗步驟：定量檢測目標(biāo)DNA片段的富集程度。高通量測序分析全基因組范圍內(nèi)的蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)。
　　
　　ChIP實(shí)驗的關(guān)鍵點(diǎn)：
　　
　　● 抗體特異性：抗體的質(zhì)量直接影響實(shí)驗結(jié)果，需選擇經(jīng)過驗證的高特異性抗體。
　　
　　● 染色質(zhì)打斷：片段大小需控制在200-1000 bp，過大或過小都會影響免疫沉淀效率。
　　
　　● 對照設(shè)置：包括Input對照、IgG對照等，確保實(shí)驗結(jié)果的可靠性。
　　
　　ChIP實(shí)驗雖然步驟較多，但通過優(yōu)化條件和選擇合適的工具（如高效的DNA打斷儀），可以顯著提高實(shí)驗效率和成功率。
　　
　　傳統(tǒng)的超聲打斷法存在諸多痛點(diǎn)：
　　
　　● 操作繁瑣，耗時耗力：?需要反復(fù)摸索超聲條件，耗時長達(dá)數(shù)小時。
　　
　　● 樣本損失大，重復(fù)性差：?超聲過程中容易產(chǎn)生熱量，導(dǎo)致樣本降解，實(shí)驗結(jié)果不穩(wěn)定。
　　
　　● 難以處理微量樣本：?傳統(tǒng)方法對樣本量要求高，難以滿足微量樣本的實(shí)驗需求。
　　
　　但別擔(dān)心！這款凈信超聲波DNA打斷儀，專為ChIP實(shí)驗量身打造！

　　非接觸超聲波DNA打斷儀：XM-26A（單槽）/XM-150A（雙槽）

　　三大優(yōu)勢，助你輕松攻克DNA打斷難題：
　　
　　● 高效便捷，省時省力：?采用獨(dú)特的非接觸超聲波DNA打斷技術(shù)，利用超聲波的能量，通過非接觸的方式對DNA樣品進(jìn)行打斷，從而得到所需的DNA片段，效率提升數(shù)倍！
　　
　　● 溫和打斷，保護(hù)樣本完整性：準(zhǔn)確控制能量輸出，避免熱效應(yīng)，較大程度保護(hù)DNA完整性，確保實(shí)驗結(jié)果準(zhǔn)確可靠。
　　
　　● 微量樣本，輕松應(yīng)對：可處理微量樣本，滿足各種實(shí)驗需求。
　　
　　這款非接觸超聲波DNA打斷儀，不僅是ChIP實(shí)驗的得力助手，還可應(yīng)用于下一代測序（NGS）文庫制備、DNA片段化分析、DNA蛋白質(zhì)相互作用研究。