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非接觸式超聲波DNA打斷儀助力唯可生物基因組樣品的前處理

  實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>將全基因組DNA樣品進(jìn)行100-500bp區(qū)間的片段化處理。
  
  實(shí)驗(yàn)儀器及材料
  
  1.實(shí)驗(yàn)儀器:小美超聲-高通量超聲波基因組剪切儀
  
  2.實(shí)驗(yàn)材料:核酸濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液

  基因組樣品DNA超聲打斷的實(shí)驗(yàn)步驟:
  
  1.提前15分鐘將三款儀器的冷水機(jī)啟動(dòng),設(shè)置溫度為4℃。
  
  2.將每個(gè)0.2mL EP管加入130 μL 濃度為12ng/μL的全基因組DNA溶液。
  
  3.將2管裝好樣品的0.2mL EP 管分別放入儀器的適配器當(dāng)中,其他空余的孔位由加同樣體積水的0.2mL EP 管補(bǔ)齊。
  
  4.程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時(shí)間20s間隔時(shí)間10s,總時(shí)長(zhǎng)分別為3分鐘和4分鐘。
  
  5.程序結(jié)束后,取出樣品使用毛細(xì)管電泳進(jìn)行基因組片段化檢測(cè)。
  
  基因組樣品DNA超聲打斷的實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
  
  1.小美超聲-高通量超聲波基因組剪切儀 程序一:
  
  ①程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時(shí)間20s 間隔時(shí)間10s,總時(shí)長(zhǎng)3分鐘
  
  平均片段大?。?88 bp, 101-503 bp區(qū)間占比 83.64%。

  2.小美超聲-高通量聲波基因組剪切儀 程序二:
  
  ②程序設(shè)置:溫度4℃,超聲工作時(shí)間20s 間隔10s,總時(shí)長(zhǎng)4分鐘
  
  平均片段大小:266 bp,99-503 bp區(qū)間占比 89.33%。

  3.實(shí)驗(yàn)結(jié)果匯總:
  
  在樣品、超聲程序設(shè)定等條件相同的情況下,使用小美超聲的高通量聲波基因組剪切儀在3分鐘和4分鐘時(shí),100-500 bp區(qū)間占比分別為83.64%和89.33%,且二者峰圖呈平緩狀,表明基因組片段均一性良好。

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