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小美超聲波打斷儀:FFPE和全血gDNA樣本的超聲打斷測(cè)試結(jié)果

實(shí)驗(yàn)條件
  
1.儀器型號(hào):小美超聲打斷儀、光鼎Qsep1全自動(dòng)核酸蛋白分析系統(tǒng)
  
2.小美打斷儀樣品條件設(shè)置:功率100%;周期打20s停10s;0.2mL離心管,樣本投入量300ng(50ul)
  
3.Qsep1核酸蛋白分析系統(tǒng)條件設(shè)置:S1高分辨率卡夾;20-1Kbp內(nèi)參marker;26-622bp size marker;8kv分離電壓
  
4.樣本類型:FFPE和全血 gDNA超聲打斷樣本

非接觸超聲波DNA打斷儀

非接觸超聲波DNA打斷儀

需要將客戶提供的FFPE gDNA樣本打斷到350bp(主峰)
  
在小美打斷儀上設(shè)置三個(gè)打斷時(shí)間梯度:20min、15min、10min,打斷后的樣本通過Qsep質(zhì)控片段分布,最后確定打斷時(shí)間10min比較合適。
  
在10min打斷時(shí)間的條件下,打斷剩余9個(gè)FFPE gDNA樣本,每個(gè)樣本做兩個(gè)重復(fù),具體結(jié)果如下:
  
FFPE gDNA原始樣本(打斷前)

FFPE-打斷20min

FFPE-打斷15min

FFPE-打斷10min

FFPE2-1

FFPE2-2

FFPE2重復(fù)性

FFPE3-1

FFPE3-2

FFPE3重復(fù)性

FFPE9-1

FFPE9-2

FFPE9重復(fù)性

FFPE12-1

FFPE12-2

FFPE12重復(fù)性

FFPE29-1

FFPE29-2

FFPE29重復(fù)性

FFPE30-1

FFPE30-2

FFPE30重復(fù)性

FFPE32-1

FFPE32-2

FFPE32重復(fù)性

FFPE33-1

FFPE33-2

FFPE33重復(fù)性

FFPE36-1

FFPE36-2

FFPE36重復(fù)性

需要將客戶提供的全血 gDNA樣本打斷到350bp(主峰)

在小美打斷儀上設(shè)置四個(gè)打斷時(shí)間梯度:15min、12min、11min、10min ,打斷后的樣本通過Qsep質(zhì)控片段分布,最后確定打斷時(shí)間11min比較合適。
  
在11min打斷時(shí)間的條件下,打斷剩余1個(gè)全血 gDNA樣本,每個(gè)樣本做兩個(gè)重復(fù),具體結(jié)果如下:
  
全血 gDNA原始樣本(打斷前)

血-打斷15min

血-打斷12min

血-打斷11min

血-打斷10min

血HNZ-1

血HNZ-2

血HNZ重復(fù)性

非接觸DNA打斷儀|全基因組DNA樣品的超聲打斷
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小美非接觸超聲波DNA打斷儀實(shí)現(xiàn)全血基因組的高效打斷|測(cè)試報(bào)告
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